Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf394Q9Z1D9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms