Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Setbp1Q9Z180 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setbp1Q9Z180 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setbp1Q9Z180 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms