Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AireQ9Z0E3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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