Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pmfbp1Q9WVQ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms