Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PapolbQ9WVP6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PapolbQ9WVP6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms