Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms