Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PoleQ9WVF7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PoleQ9WVF7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PoleQ9WVF7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PoleQ9WVF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PoleQ9WVF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PoleQ9WVF7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PoleQ9WVF7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms