Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin2Q9WVE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms