Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme3Q9WV85 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms