Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClcnkaQ9WUB7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClcnkaQ9WUB7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClcnkaQ9WUB7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClcnkaQ9WUB7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClcnkaQ9WUB7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms