Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms