Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scnn1bQ9WU38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scnn1bQ9WU38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms