Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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