Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdh13Q9WTR5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms