Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms