Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod1Q9R0E2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms