Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
AmfrQ9R049 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AmfrQ9R049 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms