Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp11cQ9QZW0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp11cQ9QZW0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms