Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2afyQ9QZQ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms