Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc3Q9QZC1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms