Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms