Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms