Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VapbQ9QY76 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms