Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp3Q9QY23 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp3Q9QY23 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms