Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nufip1Q9QXX8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms