Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms