Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3a1Q9QX15 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms