Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2bQ9JME9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms