Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prg4Q9JM99 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg4Q9JM99 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms