Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SrfQ9JM73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms