Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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