Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpc4apQ9JLV2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms