Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlr5Q9JLF7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr5Q9JLF7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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