Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tgm1Q9JLF6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgm1Q9JLF6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms