Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SacsQ9JLC8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms