Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CubnQ9JLB4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms