Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a3Q9JKZ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a3Q9JKZ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc5a3Q9JKZ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc5a3Q9JKZ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc5a3Q9JKZ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc5a3Q9JKZ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms