Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot9Q9JKY0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms