Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Habp4Q9JKS5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms