Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx6Q9JKK1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx6Q9JKK1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms