Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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