Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trem1Q9JKE2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms