Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms