Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp5Q9JKD3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp5Q9JKD3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms