Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap3m1Q9JKC8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms