Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Uchl3Q9JKB1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms