Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnga3Q9JJZ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnga3Q9JJZ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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