Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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