Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpn1Q9JJN5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpn1Q9JJN5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms