Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riox1Q9JJF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms